Livre ancien Écologie microbienne du sol

L'écologie microbienne a pour objet l'étude des interrelations entre les micro-organismes et les composantes de l'écosystème où ils vivent. Un écosystème est le système limité dans l'espace constitué par l'ensemble des communautés d'êtres vivants qui s'y trouvent et par l'ensemble des conditions énergétiques, physiques, chimiques et biologiques qui règnent au voisinage immédiat de ces êtres vivants (environnement).

Le terme d'écosystème peut être appliqué à des ensembles d'extension et de complexité variables : une culture microbienne constitue un micro-écosystème simple, un océan un macro-écosystème complexe.

L'écologie microbienne du sol, qui est une branche de l'écologie microbienne générale, a essentiellement pour objet l'étude des interactions qui, dans le cadre des écosystèmes sol-végétation, se manifestent entre les communautés microbiennes et les composantes de l'écosystème sol-végétation :

- interactions entre les communautés microbiennes et le sol (considéré comme milieu organique et minéral) : interactions A1A2 ;
- interactions entre les communautés microbiennes et la végétation : interactions B1B2 ;
- interactions entre les communautés microbiennes : interactions C1C2

Il s'agit là de problèmes complexes, puisqu'ils concernent des écosystèmes renfermant non seulement des communautés microbiennes, mais aussi des communautés animales et végétales vivant dans un environnement particulier caractérisé par des paramètres très nombreux, eux-mêmes interdépendants : l'environnement édaphique.